Webinaires Groupes Thématiques

Le Groupe de Travail ‘Cytométrie en Image’ de l’Association Française de Cytométrie propose un Webinaire le

Vendredi 14 mars à 13h

Algorithmes d’Intelligence Artificielle pour l’analyse des images  pour la Cytométrie en flux en image 

Jérémie Cosette 

GENETHON, Evry 

Département d’évaluation préclinique. Dir : Nathalie Daniele 

Pour vous connecter : Lien Teams 

En espérant vous y retrouver nombreux ! 

Le groupe ‘Cytométrie en Image’ 

V. Duplan-Eche, S. Dussurgey, Y. Demont, M. Dussiot, C. Guérin, J. Cosette, M. Boyer-Clavel, ML. Renoud, C. Knosp, L. Plantureux, P. Maraquin 

contact : valerie.duplan@inserm.fr

Le groupe de travail “Cytométrie de masse » de l’Association Française de Cytométrie est heureux de vous inviter à son prochain webinaire :

Le 28 Mars 2024 à 12h30

IL-12 et IL-23 : comportement paradoxal dans l’inflammation et le cancer

Présenté par Pr. Burkhard Becher

University of Zurich, Institute of Experimental Immunology

Lien Zoom: https://univ-amu-fr.zoom.us/j/81537671135?pwd=VzJkTUtFdWVTMm0weUZvaVE1NTE3dz09

Code : 275002

IL-12 and IL-23 are closely related cytokines and represent the most proinflammatory mediators of the IL-12 superfamily. Both cytokines are structurally similar and share both producing and sensing cell types. While IL-12 is a canonical TH type I inducing mediator, IL-23 is firmly linked with type III immunity. Both cytokines are considered central mediators of TH cell polarization and are linked with inflammation and even immunopathology. However, whilst IL-12 stimulates type 1 lymphocytes and can eliminate established tumors, the loss of IL-12 leads to drastically enhanced inflammation across various models of chronic inflammatory disease and autoimmunity. Likewise, IL-23, which plays a non-redundant function in the development of autoimmunity and type 3 immune responses, it also increases tumor growth. These at first glance paradoxically appearing properties form the focus of this presentation. I will discuss the discoveries around IL-12 and IL-23 from a historical perspective, taking into account the most recent findings on their immunoregulatory properties in the context of inflammation and cancer in particular and immunity in general.

Quantifier l’état physiologique des bactéries sporulées. Cytométrie en flux et microbiologie prévisionnelle

Les bactéries sporulées, appartenant aux ordres des Bacilliales et à la classe des Clostridia, peuvent être une cause majeure d’altération ou d’intoxication alimentaire. Lorsqu’elles sont sous forme de spores, ces bactéries sont capables de résister à de nombreux traitements comme les traitements thermiques, les traitements chimiques ou d’autres techniques de décontamination comme la lumière pulsée.

La cytométrie en flux permet la discrimination des spores dormantes, des spores germées et des cellules végétatives ……… la suite ici

Présenté par :

Clément Trunet, maître de conférences à l’Université de Bretagne Occidentale

Lundi 18 Mars 2024 à 13h30-14h15

Lien d’inscription (gratuite) au webinaire : Cliquez

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A très bientôt ! 

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Le Groupe de Travail ‘Cytométrie en Image’ de l’Association Française de Cytométrie

propose un Webinar

Vendredi 9 Février à 14h

Cytométrie en flux en image appliquée à C. elegans: stadification, étude et tri d’embryons vivants sur la base de leurs propriétés natives

Romain Bulteau

Laboratoire de Biologie et de Modélisation de la Cellule (LBMC), Lyon Equipe ‘Quantitative regulatory genomics’ dirigée par Mirko Francesconi

L’inscription est obligatoire via le formulaire suivant :  lien

Date limite d’inscription le 7 Février 2024. Le lien de la rencontre vous sera envoyé une fois l’inscription réalisée.

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le groupe ‘Cytométrie en Image’

V. Duplan-Eche, S. Dussurgey, Y. Demont, M. Dussiot, C. Guérin, J. Cosette, M. Boyer-Clavel, ML.  Renoud,

AL. Raveu, A. Malfait-Jobart, C. Knosp, L. Plantureux  

contact : valerie.duplan@inserm.fr

Le groupe de travail “Cytométrie de masse » de l’Association Française de Cytométrie est heureux de vous inviter à son prochain webinaire :

Mardi 7 novembre 2023 à 12h30

Caractérisation des lymphocytes T régulateur dans le cancer du poumon.

Présenté par Stephane Fattori

Immunomonitoring department, Pauli Calmettes Institute, CRM, Marseille

Lien Zoom : https://univ amu fr.zoom.us/j/86931336119?pwd= TEgzb01ZM0FucFhKb3hEdmk5VEpKZz09
Login code: 725552

Abstract :
Triple negative breast cancer (TNBC) is the deadliest subtype of breast cancer Standard treatments for
patients with early stage, locally advanced or metastatic TNBC include the combination of neoadjuvant
chemotherapy and pembrolizumab, an immune checkpoint blockade targeting the programmed cell
death 1 (PD-1) receptor PD-1 blockade reinvigorate tumor antigen specific CD8+ T cells in primary TNBC.
However, approximately 40 and 80 of early stage and advanced or metastatic TNBC are resistant to
PD 1 blockade therapy, respectively.
Regulatory T cells (Tregs) are an immunosuppressive subset of CD4+ T cells essential for maintaining self
tolerance in physiological settings. Abundant tumor infiltration by Tregs harbouring hallmarks of highly
suppressive CD25high effector Tregs (eTregs) has been associated with resistance to PD 1 blockade in
cancer indications for which pembrolizumab was approved much earlier than for TNBC, such as non
small cell lung cancer. In contrast, in TNBC, the prognostic value of intratumoral Tregs remains
controversial and no association between baseline levels of eTregs and responses to PD 1 blockade
therapy has been reported, despite the clinical significance of this cancer indication. In the present
thesis, we used single cell technologies to dissect the nature and function of eTreg during TNBC
progression. We found that an immunosuppressive TNBC microenvironment resistant to PD-1 blockade
therapy is marked by an imbalance between effector CD8+ T cells and CD25 high eTregs. We further
identified CD25 as the most selective surface marker of eTregs in primary TNBC and associated
metastases for limited on target/off target effects. In a syngeneic TNBC model, selective Treg depletion
by a next generation anti-CD25 monoclonal antibody (mAb; ALD 2510; Alderaan Biotechnology)
synergized with PD-1 blockade to safely mediate durable tumor growth control by increasing effector
αβCD8+ T cell/Treg ratios in tumors and in the peripheral blood Overall, we propose that Treg depletion
by next generation anti-CD25 mAb could improve clinical responses to PD-1 blockade therapy in patients
with TNBC at different stage of the disease

Le Groupe Analyse de données de l’Association Française de Cytométrie

Vous invite à son 4^e Webinar 2023

Nouveau logiciel- Scyan

Basé sur des connaissances biologiques préalables, Scyan fournit une annotation
rapide des populations cellulaires sans nécessiter d’étiquette d’apprentissage. Scyan
produit un modèle interprétable qui corrige également l’effet de lot et peut être utilisé
pour le débarcodage, l’échantillonnage de cellules et la découverte de populations.https://doi.org/10.1093/bib/bbad260

Présenté par :

Q. Blampey

Université Paris-Saclay, CentraleSupélec,
Laboratory of Mathematics and Computer Science (MICS),
3 rue Joliot Curie, 91190 Gif-sur-Yvette, France

Jeudi 26 Octobre 2023 / 13h00 – 14h00

Posez vos questions sur le forum de l’AFC avant le webinar
Lien de connexion ZOOM au webinar

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A très bientôt ! 

Aïda MEGHRAOUI & Samuel GRANJEAUD 

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Viabilité des microorganismes : 
marquages classiques et nouveautés pour les pathogènes

La cytométrie en flux permet l’analyse rapide et le comptage des microorganismes dans une suspension. Associée à des marqueurs fluorescents de viabilité/mortalité, il est possible de dénombrer en moins de 30min les levures ou les bactéries totales, viables et mortes présentes dans une suspension. Dans le cas des bactéries pathogènes des précautions supplémentaires doivent être prises pour protéger les opérateurs. Ce webinaire présentera les méthodes classiques et maintenant largement utilisées pour le dénombrement des microorganismes viables et morts, mais aussi les nouveautés avec des marqueurs fixables qui permettent de mieux prendre en compte la sécurité sur les plateformes de cytométrie.

Présenté par :

Claire Saulou-Bérion – AgroParisTech, UMR SayFood, Université Paris-Saclay

Sophie Viel – INSERM, Plateforme CYM, Université Paris-Saclay

Lundi 25 Septembre 2023 à 13h30

Lien d’inscription (gratuite) au webinaire : Cliquez

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A très bientôt ! 

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Le Groupe Analyse de données de l’Association Française de Cytométrie

Vous invite à son 3^e Webinar 2023

Décryptage

Construire une heatmap d’abondance informative

Présenté par :

S. Granjeaud

Plateforme Bioinformatique

Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille, Marseille, France

Jeudi 29 Juin 2023 / 13h00 – 14h00

Posez vos questions sur le forum de l’AFC avant le webinar
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Aïda MEGHRAOUI & Samuel GRANJEAUD 

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Le groupe de travail “Cytométrie spectrale » de l’Association Française de Cytométrie vous propose le webinaire :

Pathogenic bacterial sorting using Bigfoot cell 

Présenté par Paul Robinson and Narayana Iyengar, Sharath Tippur

Department of Basic Medical Sciences

Purdue University College of Veterinary Medicine
625 Harrison Street
West Lafayette, IN 47907

Le Mardi 20 juin 2023 / 14h

Lien zoom :  Cliquez

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le groupe cytométrie spectrale

Le groupe de travail “Cytométrie de masse » de l’Association Française de Cytométrie est heureux de vous inviter à son prochain webinar :

Mercredi 7 juin à 13h

Live-Cell Barcoding with Anti-CD45 Antibodies for Mass Cytometry

Présenté par Pauline Maby

Immunomonitoring department, Pauli Calmettes Institute, Marseille

Lien zoom : https://univ-amu-fr.zoom.us/j/87588252730?pwd=ek5ZQytnSEd6Q21ZM3FvZ3Bka3lQZz09

Résumé : Le codage à barres CD45 des cellules vivantes implique la coloration d’échantillons de cellules immunitaires avec des combinaisons uniques d’anticorps anti-CD45 comme identificateurs d’échantillons. Cela permet le regroupement d’échantillons afin de les traiter comme un échantillon de cellule unique pour la coloration et l’acquisition des cellules. Il améliore le flux de travail, améliore la cohérence des données et réduit l’utilisation de réactifs.

Au cours de ce webinaire, nous discuterons de toutes les étapes d’une expérience de codage à barres CD45 sur cellules vivantes, de la conception du panel à l’analyse des données. Tout d’abord, lors du panel design, il est important de s’assurer que la coloration CD45 n’interfère pas avec la détection de marqueurs d’intérêt dans d’autres canaux. Ensuite, plusieurs ajustements doivent être apportés aux procédures de coloration et d’acquisition. Enfin, les fichiers FCS obtenus à partir d’échantillons de cellules à code-barres sont décodés pour attribuer chaque événement cellulaire à son échantillon d’origine.

En espérant vous y retrouver nombreux !

A très bientôt ! 

Olivier MOLENDI-COSTE & Anne-Sophie CHRETIEN

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Le Groupe Microbiologie-Cytométrie de l’Association Française de Cytométrie

Vous invite à son Webinar 2023

Vitalité Cellulaire

La vitalité cellulaire dépend de la charge énergétique des cellules. Elle se traduit par la cinétique des réactions métaboliques ou activité métabolique. Dans les industries de fermentation, les ferments doivent être viables mais aussi actifs pour coloniser rapidement le milieu en début de fermentation. On peut aussi évaluer l’effet de stress sur les cellules par la mesure de vitalité. La cytométrie en flux permet de mesurer en 30min la vitalité cellulaire, ce qui est plus simple et plus rapide que les mesures cinétiques d’activités métaboliques. Ce webinaire présentera la méthode avec quelques exemples de corrélation avec des mesures d’activités sur des levures et des bactéries.

Présenté par :

Marielle BOUIX

Responsable du groupe thématique Microbiologie-Cytométrie SFM

Mardi 30 Mai 2023 / 13h30 – 14h15

Lien de connexion au webinar : Cliquez

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Le Groupe Analyse de données de l’Association Française de Cytométrie

Vous invite à son 2^e Webinar 2023

Décryptage

Pour lire une heatmap, il faut savoir la construire

Présenté par :

S. Granjeaud

Plateforme Bioinformatique

Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille, Marseille, France

Mercredi 10 Mai 2023 / 13h00 – 14h00

Posez vos questions sur le forum de l’AFC avant le webinar
Lien de connexion ZOOM au webinar

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Aïda MEGHRAOUI & Samuel GRANJEAUD 

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Le Groupe Cytométrie de masse de l’Association Française de Cytométrie

Vous invite à son prochain Webinar

Amélioration de la segmentation unicellulaire et de l’analyse d’imagerie sur lame entière grâce à l’immunofluorescence à double modalité et à la cytométrie de masse par imagerie

Présenté par : John Lizhe Zhuang

Department of Oncology, University of Cambridge

le Mardi 2 Mai 2023 à 16h00

Lien de connexion ZOOM

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Olivier MOLENDI-COSTE & Anne-Sophie CHRETIEN

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Le groupe de travail “Cytométrie de masse » de l’Association Française de Cytométrie vous propose un webinaire :

Vendredi 31 mars 2023 à partir de 12:00

Spatial profiling reveals molecular and immunological hallmarks
of colorectal cancer tumourigenesis

Présenté par Jessica Roelands

Department of Pathology, Leiden University Medical Center (LUMC), Leiden
Cancer Immunogenomics Group

Lien Zoom : lien

Affiche du webinars : Ici

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le groupe ‘Cytométrie en masse’

Le groupe de travail “Cytométrie en Image » de l’Association Française de Cytométrie vous propose un webinaire :

Lundi 13 mars 2023 de 13h30 à 14h15

L’imagerie par cytométrie de masse : Dévoiler l’intimité des relations cellules-cellules in situ

Présenté par Henri Alexandre Michaud

Equipe Immunité et Cancer, Plateforme de Cytométrie et d’Imagerie de Masse

Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM)

L’inscription est obligatoire via le formulaire suivant : lien

Date limite d’inscription : 8 mars 2023

Le lien vous sera envoyé une fois l’inscription réalisée.

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le groupe ‘Cytométrie en Image’

V. Duplan-Eche, S. Dussurgey, Y. Demont, M. Dussiot, C. Guérin, J. Cosette, M. Boyer-Clavel, F. Hédin, ML.  Renoud, AL. Raveu, A. Malfait-Jobart  

contact : valerie.duplan@inserm.fr

Le Groupe Analyse de données de l’Association Française de Cytométrie

Vous invite à son 1^er Webinar 2023

Journal Club

Les Bonnes Pratiques de l’analyse de données multidimensionnelles :

« Lietchi et al., 2021 » soulignent les étapes clés et les pièges à éviter

Présenté par :

A.L. Iscache

Jeudi 26 Janvier 2023 de 13h00 à 14h00

Lien vers l’article Lietchi et al. 2021

Posez vos questions sur le forum de l’AFC avant le webinar
Lien de connexion TEAMS au webinar

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A très bientôt ! 

Aïda MEGHRAOUI & Samuel GRANJEAUD 

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Chers collègues,

Le CytHem est heureux de vous informer que, suite au travail de cytométrie MFI30 réalisé sous l’égide de l’AFC, un webinar intitulé « Tout savoir sur le CD30 » aura lieu le vendredi 21 octobre de 13h à 14h30 (programme ci-dessous).

Voici le lien teams à ouvrir avec Chrome :

Cliquez ici pour participer à la réunion

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le Groupe ‘Cythem’

Le Groupe de Travail ‘Cytométrie en Image’ de l’Association Française de Cytométrie propose un Webinar

Lundi 03 Octobre 2022 de 13h30 à 14h15

Intérêt de la cytométrie en image dans l’évaluation de l’expression et de la localisation de la protéine TRIM37 au cours du cycle cellulaire dans une lignée de chondrocytes

Benjamin Brigant

L’inscription est obligatoire via le formulaire suivant :  lien

Date limite d’inscription le 28 Septembre 2022. Le lien de la rencontre vous sera envoyé une fois l’inscription réalisée.

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le groupe ‘Cytométrie en Image’

V. Duplan-Eche, S. Dussurgey, Y. Demont, M. Dussiot, C. Guérin, J. Cosette, M. Boyer-Clavel, F. Hédin, ML.  Renoud, AL. Raveu, A. Malfait-Jobart  

contact : valerie.duplan@inserm.fr

Le Groupe de Travail ‘Cytométrie en Image’ de l’Association Française de Cytométrie propose un Webinar

Lundi 21 Mars 2022 de 13h30 à 14h45

• 13h30-14h40 : Polarisations moléculaire et morphologique dans les lymphocytes T Jérôme Delon, Institut Cochin, Paris
• 14h00-14h45 : Table ronde : Analyse de données sur la colocalisation (logiciel IDEAS) Michaël Dussiot, Institut Imagine, paris

L’inscription est obligatoire via le formulaire suivant :  lien

Date limite d’inscription le 09 Mars 2022. Le lien de la rencontre vous sera envoyé une fois l’inscription réalisée.

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le groupe ‘Cytométrie en Image’

V. Duplan-Eche, S. Dussurgey, Y. Demont, C. Guérin, M. Dussiot, J. Cosette, F. Hédin, T. Andrieu, M. Boyer-Clavel

contact : valerie.duplan@inserm.fr

Le Cytof Group France est heureux d’accueillir pour son 3° Webinar,

le 20 Octobre 2021 de 14h à 17h

Florian Farcette, Research Account Executive Europe South, Visiopharm, Hørsholm, Denmark 

www.visiopharm.com

Ghislaine Lioux, Application Scientist, EMEA, Indica Labs, Albuquerque, USA

www.indicalab.com

Deux logiciels seront présentés : Visiopharm et HALO®.

N’hésitez pas à diffuser largement cette annonce autour de vous

Liens de connexion pour participer à la réunion Zoom: https://univ-amu-fr.zoom.us/j/99599832758?pwd=NVZXVSt0LzR3N2tZbWwrd2tnZDV5QT09

ID de réunion : 995 9983 2758

Code secret :  684488

à très bientôt !

Anne-Sophie et Olivier