Webinars Groupes Thématiques

Viabilité des microorganismes : 
marquages classiques et nouveautés pour les pathogènes

La cytométrie en flux permet l’analyse rapide et le comptage des microorganismes dans une suspension. Associée à des marqueurs fluorescents de viabilité/mortalité, il est possible de dénombrer en moins de 30min les levures ou les bactéries totales, viables et mortes présentes dans une suspension. Dans le cas des bactéries pathogènes des précautions supplémentaires doivent être prises pour protéger les opérateurs. Ce webinaire présentera les méthodes classiques et maintenant largement utilisées pour le dénombrement des microorganismes viables et morts, mais aussi les nouveautés avec des marqueurs fixables qui permettent de mieux prendre en compte la sécurité sur les plateformes de cytométrie.

Présenté par :

Claire Saulou-Bérion – AgroParisTech, UMR SayFood, Université Paris-Saclay

Sophie Viel – INSERM, Plateforme CYM, Université Paris-Saclay

Lundi 25 Septembre 2023 à 13h30

Lien d’inscription (gratuite) au webinaire : Cliquez

Merci de diffuser cette annonce autour de vous.

A très bientôt ! 

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Le Groupe Analyse de données de l’Association Française de Cytométrie

Vous invite à son 3^e Webinar 2023

Décryptage

Construire une heatmap d’abondance informative

Présenté par :

S. Granjeaud

Plateforme Bioinformatique

Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille, Marseille, France

Jeudi 29 Juin 2023 / 13h00 – 14h00

Posez vos questions sur le forum de l’AFC avant le webinar
Lien de connexion ZOOM au webinar

Merci de diffuser cette annonce autour de vous.

A très bientôt ! 

Aïda MEGHRAOUI & Samuel GRANJEAUD 

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Le groupe de travail “Cytométrie spectrale » de l’Association Française de Cytométrie vous propose le webinaire :

Pathogenic bacterial sorting using Bigfoot cell 

Présenté par Paul Robinson and Narayana Iyengar, Sharath Tippur

Department of Basic Medical Sciences

Purdue University College of Veterinary Medicine
625 Harrison Street
West Lafayette, IN 47907

Le Mardi 20 juin 2023 / 14h

Lien zoom :  Cliquez

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le groupe cytométrie spectrale

Le groupe de travail “Cytométrie de masse » de l’Association Française de Cytométrie est heureux de vous inviter à son prochain webinar :

Mercredi 7 juin à 13h

Live-Cell Barcoding with Anti-CD45 Antibodies for Mass Cytometry

Présenté par Pauline Maby

Immunomonitoring department, Pauli Calmettes Institute, Marseille

Lien zoom : https://univ-amu-fr.zoom.us/j/87588252730?pwd=ek5ZQytnSEd6Q21ZM3FvZ3Bka3lQZz09

Résumé : Le codage à barres CD45 des cellules vivantes implique la coloration d’échantillons de cellules immunitaires avec des combinaisons uniques d’anticorps anti-CD45 comme identificateurs d’échantillons. Cela permet le regroupement d’échantillons afin de les traiter comme un échantillon de cellule unique pour la coloration et l’acquisition des cellules. Il améliore le flux de travail, améliore la cohérence des données et réduit l’utilisation de réactifs.

Au cours de ce webinaire, nous discuterons de toutes les étapes d’une expérience de codage à barres CD45 sur cellules vivantes, de la conception du panel à l’analyse des données. Tout d’abord, lors du panel design, il est important de s’assurer que la coloration CD45 n’interfère pas avec la détection de marqueurs d’intérêt dans d’autres canaux. Ensuite, plusieurs ajustements doivent être apportés aux procédures de coloration et d’acquisition. Enfin, les fichiers FCS obtenus à partir d’échantillons de cellules à code-barres sont décodés pour attribuer chaque événement cellulaire à son échantillon d’origine.

En espérant vous y retrouver nombreux !

A très bientôt ! 

Olivier MOLENDI-COSTE & Anne-Sophie CHRETIEN

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Le Groupe Microbiologie-Cytométrie de l’Association Française de Cytométrie

Vous invite à son Webinar 2023

Vitalité Cellulaire

La vitalité cellulaire dépend de la charge énergétique des cellules. Elle se traduit par la cinétique des réactions métaboliques ou activité métabolique. Dans les industries de fermentation, les ferments doivent être viables mais aussi actifs pour coloniser rapidement le milieu en début de fermentation. On peut aussi évaluer l’effet de stress sur les cellules par la mesure de vitalité. La cytométrie en flux permet de mesurer en 30min la vitalité cellulaire, ce qui est plus simple et plus rapide que les mesures cinétiques d’activités métaboliques. Ce webinaire présentera la méthode avec quelques exemples de corrélation avec des mesures d’activités sur des levures et des bactéries.

Présenté par :

Marielle BOUIX

Responsable du groupe thématique Microbiologie-Cytométrie SFM

Mardi 30 Mai 2023 / 13h30 – 14h15

Lien de connexion au webinar : Cliquez

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A très bientôt ! 

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Le Groupe Analyse de données de l’Association Française de Cytométrie

Vous invite à son 2^e Webinar 2023

Décryptage

Pour lire une heatmap, il faut savoir la construire

Présenté par :

S. Granjeaud

Plateforme Bioinformatique

Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille, Marseille, France

Mercredi 10 Mai 2023 / 13h00 – 14h00

Posez vos questions sur le forum de l’AFC avant le webinar
Lien de connexion ZOOM au webinar

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A très bientôt ! 

Aïda MEGHRAOUI & Samuel GRANJEAUD 

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Le Groupe Cytométrie de masse de l’Association Française de Cytométrie

Vous invite à son prochain Webinar

Amélioration de la segmentation unicellulaire et de l’analyse d’imagerie sur lame entière grâce à l’immunofluorescence à double modalité et à la cytométrie de masse par imagerie

Présenté par : John Lizhe Zhuang

Department of Oncology, University of Cambridge

le Mardi 2 Mai 2023 à 16h00

Lien de connexion ZOOM

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A très bientôt ! 

Olivier MOLENDI-COSTE & Anne-Sophie CHRETIEN

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Le groupe de travail “Cytométrie de masse » de l’Association Française de Cytométrie vous propose un webinaire :

Vendredi 31 mars 2023 à partir de 12:00

Spatial profiling reveals molecular and immunological hallmarks
of colorectal cancer tumourigenesis

Présenté par Jessica Roelands

Department of Pathology, Leiden University Medical Center (LUMC), Leiden
Cancer Immunogenomics Group

Lien Zoom : lien

Affiche du webinars : Ici

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le groupe ‘Cytométrie en masse’

Le groupe de travail “Cytométrie en Image » de l’Association Française de Cytométrie vous propose un webinaire :

Lundi 13 mars 2023 de 13h30 à 14h15

L’imagerie par cytométrie de masse : Dévoiler l’intimité des relations cellules-cellules in situ

Présenté par Henri Alexandre Michaud

Equipe Immunité et Cancer, Plateforme de Cytométrie et d’Imagerie de Masse

Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM)

L’inscription est obligatoire via le formulaire suivant : lien

Date limite d’inscription : 8 mars 2023

Le lien vous sera envoyé une fois l’inscription réalisée.

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le groupe ‘Cytométrie en Image’

V. Duplan-Eche, S. Dussurgey, Y. Demont, M. Dussiot, C. Guérin, J. Cosette, M. Boyer-Clavel, F. Hédin, ML.  Renoud, AL. Raveu, A. Malfait-Jobart  

contact : valerie.duplan@inserm.fr

Le Groupe Analyse de données de l’Association Française de Cytométrie

Vous invite à son 1^er Webinar 2023

Journal Club

Les Bonnes Pratiques de l’analyse de données multidimensionnelles :

« Lietchi et al., 2021 » soulignent les étapes clés et les pièges à éviter

Présenté par :

A.L. Iscache

Jeudi 26 Janvier 2023 de 13h00 à 14h00

Lien vers l’article Lietchi et al. 2021

Posez vos questions sur le forum de l’AFC avant le webinar
Lien de connexion TEAMS au webinar

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A très bientôt ! 

Aïda MEGHRAOUI & Samuel GRANJEAUD 

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Chers collègues,

Le CytHem est heureux de vous informer que, suite au travail de cytométrie MFI30 réalisé sous l’égide de l’AFC, un webinar intitulé « Tout savoir sur le CD30 » aura lieu le vendredi 21 octobre de 13h à 14h30 (programme ci-dessous).

Voici le lien teams à ouvrir avec Chrome :

Cliquez ici pour participer à la réunion

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le Groupe ‘Cythem’

Le Groupe de Travail ‘Cytométrie en Image’ de l’Association Française de Cytométrie propose un Webinar

Lundi 03 Octobre 2022 de 13h30 à 14h15

Intérêt de la cytométrie en image dans l’évaluation de l’expression et de la localisation de la protéine TRIM37 au cours du cycle cellulaire dans une lignée de chondrocytes

Benjamin Brigant

L’inscription est obligatoire via le formulaire suivant :  lien

Date limite d’inscription le 28 Septembre 2022. Le lien de la rencontre vous sera envoyé une fois l’inscription réalisée.

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le groupe ‘Cytométrie en Image’

V. Duplan-Eche, S. Dussurgey, Y. Demont, M. Dussiot, C. Guérin, J. Cosette, M. Boyer-Clavel, F. Hédin, ML.  Renoud, AL. Raveu, A. Malfait-Jobart  

contact : valerie.duplan@inserm.fr

Le Groupe de Travail ‘Cytométrie en Image’ de l’Association Française de Cytométrie propose un Webinar

Lundi 21 Mars 2022 de 13h30 à 14h45

• 13h30-14h40 : Polarisations moléculaire et morphologique dans les lymphocytes T Jérôme Delon, Institut Cochin, Paris
• 14h00-14h45 : Table ronde : Analyse de données sur la colocalisation (logiciel IDEAS) Michaël Dussiot, Institut Imagine, paris

L’inscription est obligatoire via le formulaire suivant :  lien

Date limite d’inscription le 09 Mars 2022. Le lien de la rencontre vous sera envoyé une fois l’inscription réalisée.

En espérant vous y retrouver nombreux !

Le groupe ‘Cytométrie en Image’

V. Duplan-Eche, S. Dussurgey, Y. Demont, C. Guérin, M. Dussiot, J. Cosette, F. Hédin, T. Andrieu, M. Boyer-Clavel

contact : valerie.duplan@inserm.fr

Le Cytof Group France est heureux d’accueillir pour son 3° Webinar,

le 20 Octobre 2021 de 14h à 17h

Florian Farcette, Research Account Executive Europe South, Visiopharm, Hørsholm, Denmark 

www.visiopharm.com

Ghislaine Lioux, Application Scientist, EMEA, Indica Labs, Albuquerque, USA

www.indicalab.com

Deux logiciels seront présentés : Visiopharm et HALO®.

N’hésitez pas à diffuser largement cette annonce autour de vous

Liens de connexion pour participer à la réunion Zoom: https://univ-amu-fr.zoom.us/j/99599832758?pwd=NVZXVSt0LzR3N2tZbWwrd2tnZDV5QT09

ID de réunion : 995 9983 2758

Code secret :  684488

à très bientôt !

Anne-Sophie et Olivier

Le Groupe « Cytométrie en Image » vous propose une 2^° rencontre sous forme de Webinar le

Vendredi 17 septembre 2021 de 13h30 à 14h15

« Analyse en Cytométrie en Image : des outils actuels jusqu’au deep learning« 

Yohann Demont, CHU Amiens et Michaël Dussiot, Institut Imagine Paris

L’inscription est obligatoire via le formulaire suivant :  lien

Date limite d’inscription le 13 septembre 2021.

Le lien de la rencontre vous sera envoyé une fois l’inscription réalisée.

Nous vous attendons encore nombreux !

Le groupe ‘Cytométrie en Image’ 

V. Duplan-Eche, S. Dussurgey, Y. Demont, C. Guérin, M. Dussiot, J. Cosette, F. Hédin, T. Andrieu

contact : valerie.duplan@inserm.fr

Le Groupe de « Cytométrie spectrale » est heureux d’accueillir pour son 1° Webinar,

vendredi 25 juin à 14h :

Bartek RAJWA, PhD, Assistant Professor, Purdue University 

« Spectral Methods in Microscopy and Flow Cytometry. From spectral fingerprints to pattern classification. »

N’hésitez pas à diffuser largement cette annonce autour de vous

Liens de connexion pour participer à la réunion Zoom:

https://univ-cotedazur.zoom.us/j/86087009655?pwd=WHJNRGEzSXJGSmxWOXVZazFhZlYzQT09

ID de réunion : 860 8700 9655

Code secret : 443094

à très bientôt !

Julie, Catherine, Thierry et Pierre

Le Groupe de Travail « Cytométrie en Image » de l’AFC vous propose des rencontres sous forme de Webinars.

Notre objectif est de favoriser les échanges scientifiques entre utilisateurs confirmés ou novices de la Cytométrie en Image, afin de promouvoir l’émergence d’applications, l’intégration de nouvelles approches de traitements de données, ou plus simplement, la diffusion de bonnes pratiques. 

La première rencontre aura lieu : Lundi 14 Juin 2021 de 13h30 à 14h15

– 13h30-13h40 : Présentation du Groupe de Travail ‘Cytométrie en Image’. Valérie Duplan-Eche, Infinity, Toulouse

– 13h40-14h15 : La Cytométrie en Image : en suspension, adhérente, au sein des tissus, la cellule dans tous ses états. Coralie Guérin, Institut Curie, Paris et Jérémie Cosette, Généthon, Evry

L’inscription est obligatoire via le formulaire suivant : lien

Date limite d’inscription le 7 Juin 2021. Le lien de la rencontre vous sera envoyé une fois l’inscription réalisée.

Nous vous attendons nombreux !

Le groupe ‘Cytométrie en Image’

V. Duplan-Eche, S. Dussurgey, Y. Demont, C. Guérin, M. Dussiot, J. Cosette, F. Hédin, T. Andrieu

contact : valerie.duplan@inserm.fr

Bonjour les Cytofeurs.euses !

Tout d’abord, une excellente année à tous, pleine de surprises, d’amour, de bonne santé, et de p’tites picouses!

Pour relancer l’activité du Cytof Group France, un premier webinar aura lieu le mercredi 20 Janvier, 14h, et portera sur la normalisation de l’effet de batch via le Cytof Batch Adjust. Vous trouverez les résumés ici.

Speakers : Samuel Granjeaud et moi-même.

Donc à vos agendas, cela sera en Français et nous vous enverrons le lien de la réunion le matin même.

Merci de vous inscrire par retour de mail à l’adresse suivante :oliviermolendi@hotmail.com

à très bientôt !

Olivier