Cytométrie en image

Description

La cytométrie en Image, à l’interface entre la cytométrie en flux conventionnelle et la microscopie permet de quantifier de nombreux paramètres morphologiques sur un grand nombre de cellules. Cette technologie est utilisée dans différents domaines (immunologie, cancérologie, microbiologie, parasitologie…) avec des applications multiples allant de l’analyse de morphologie, à des mesures d’internalisation, de translocation, de co-localisation, d’interaction cellulaire, d’analyse de cycle cellulaire, d’autophagie ou de comptage de spots…

L’objectif de ce groupe, qui réunit des experts de différents instituts de recherche francophones, est de favoriser les échanges scientifiques entre utilisateurs confirmés ou novices afin de promouvoir l’émergence d’applications, l’intégration de nouvelles approches de traitements de données, ou plus simplement, la diffusion de bonnes pratiques. Par le biais de ce groupe et à travers l’AFC, nous souhaitons rendre plus visible et dynamiser cette technologie en proposant divers évènements soutenus par cette association (des journées thématiques et/ou ateliers, formations).

Listing des acteurs:

– Valérie Duplan-Eche                   Infinity, Toulouse                                                 <valerie.duplan@inserm.fr>
– Sébastien Dussurgey                 SFR Biosciences, Lyon                                       <sebastien.dussurgey@inserm.fr>
– Yohann Demont                          CHU, Amiens                                                      <demont.yohann@chu-amiens.fr>
– Michaël Dussiot                           Institut IMAGINE, Paris                                      <michael.dussiot@gmail.com>
– Coralie Guérin                             Institut Curie, Paris                                             <coralie.guerin@curie.fr>
– Jérémie Cosette                          Généthon, Evry                                                  <jcosette@genethon.fr>
– Fanny Hédin                                Luxembourg Insitute of Health                           <Fanny.Hedin@lih.lu>
– Myriam Boyer-Clavel                   IGMM, Montpellier                                              <myriam.boyer-clavel@igmm.cnrs.fr>
– Marie-Laure Renoud                    Restore, Toulouse                                              <marie-laure.renoud@inserm.fr>
– Anne-Laure Raveu                       Cymages, Université de Versailles                    <anne-laure.raveu@uvsq.fr>
– Aude Malfait-Jobart                      Cymages, Université de Versailles                    <aude.malfait-jobart@inserm.fr>

Les coordinateurs

Valérie Duplan-Eche

Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (INFINITy)

Inserm UMR1291 – CNRS UMR5051 , Université Toulouse III

Bât F / CHU Purpan – BP 3028

31024 Toulouse cedex 3

+33 (0)5 31 54 79 11

valerie.duplan@inserm.fr

Les comptes-rendus

Réunions du groupe :

24 Juin 2020 : Présentation et définition des objectifs du groupe

19 Octobre 2020 : Présentation d’outils ‘open source’ pour l’analyse des données (Yohann Demont)

3 Novembre 2020 : Présentation de nouvelles approches pour le traitement des données ‘Machine Learning et Intelligence Artificielle’ (Luminex)

1 Janvier 2021 : Discussion sur l’organisation de webinars

9 Mars 2021 : Format des webinars avec calendrier prévisionnel (1er Webinar prévu le 14 Juin 2021, à confirmer)

 

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