Cytométrie en image

Description

La cytométrie en Image, à l’interface entre la cytométrie en flux conventionnelle et la microscopie permet de quantifier de nombreux paramètres morphologiques sur un grand nombre de cellules. Cette technologie est utilisée dans différents domaines (immunologie, cancérologie, microbiologie, parasitologie…) avec des applications multiples allant de l’analyse de morphologie, à des mesures d’internalisation, de translocation, de co-localisation, d’interaction cellulaire, d’analyse de cycle cellulaire, d’autophagie ou de comptage de spots…

L’objectif de ce groupe, qui réunit des experts de différents instituts de recherche francophones, est de favoriser les échanges scientifiques entre utilisateurs confirmés ou novices afin de promouvoir l’émergence d’applications, l’intégration de nouvelles approches de traitements de données, ou plus simplement, la diffusion de bonnes pratiques. Par le biais de ce groupe et à travers l’AFC, nous souhaitons rendre plus visible et dynamiser cette technologie en proposant divers évènements soutenus par cette association (des journées thématiques et/ou ateliers, formations).

Listing des acteurs:

– Valérie Duplan-Eche                 Infinity, Toulouse                                           valerie.duplan@inserm.fr
– Sébastien Dussurgey              SFR Biosciences, Lyon                                sebastien.dussurgey@inserm.fr
– Yohann Demont                       CHU, Amiens                                                demont.yohann@chu-amiens.fr
– Michaël Dussiot                        Institut IMAGINE, Paris                                 michael.dussiot@gmail.com
– Coralie Guérin                           Institut Curie, Paris                                      coralie.guerin@curie.fr
– Jérémie Cosette                       Généthon, Evry                                             jcosette@genethon.fr
– Myriam Boyer-Clavel                 IGMM, Montpellier                                         myriam.boyer-clavel@igmm.cnrs.fr
– Marie-Laure Renoud                 Restore, Toulouse                                         marie-laure.renoud@inserm.fr
– Anne-Laure Raveu                    Cymages, Université de Versailles               anne-laure.raveu@uvsq.fr
– Aude Malfait-Jobart                   Cymages, Université de Versailles                aude.malfait-jobart@inserm.fr
– Camille Knosp                          PARCC, Paris                                                camille.knosp@inserm.fr
– Léa Plantureux                          AMUTICYT, Marseille                                     lea.plantureux@univ-amu.fr

Les coordinateurs

Valérie Duplan-Eche

Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (INFINITy)

Inserm UMR1291 – CNRS UMR5051 , Université Toulouse III

Bât F / CHU Purpan – BP 3028

31024 Toulouse cedex 3

+33 (0)5 31 54 79 11

valerie.duplan@inserm.fr

Les comptes-rendus

Réunions du groupe :

24 Juin 2020 : Présentation et définition des objectifs du groupe

19 Octobre 2020 : Présentation d’outils ‘open source’ pour l’analyse des données (Yohann Demont)

3 Novembre 2020 : Présentation de nouvelles approches pour le traitement des données ‘Machine Learning et Intelligence Artificielle’ (Luminex)

1 Janvier 2021 : Discussion sur l’organisation de webinars

9 Mars 2021 : Format des webinars avec calendrier prévisionnel (1er Webinar prévu le 14 Juin 2021, à confirmer)

 

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